南京位于中国华东地区和长江下游流域的中心，是重要的交通枢纽。

    市内公共交通.南京街头各种交通工具南京市拥有较为便捷的公交网络，目前由四家公司运营(总公司、中北巴士、雅高巴士和新城巴士)，有170多条线路通达城市主城区所有部分。南京地铁一号线已经投入使用两年，在“十运会”期间获得好评，二号线将于2008初投入运营，南京市规划于2050年建成长达433公里的包括地铁和轻轨的轨道交通网络。
公路 南京有60多条国道和省道连接中国其他区域。有沪宁、宁合、宁杭、宁通、宁连等高速公路。南京都市圈建设宁扬（州）、宁镇（江）、宁淮（安）、宁蚌（埠）、宁合（肥）、宁芜（湖）、宁杭（州）和宁高（淳）等8条运输通道。南京市内有公路里程230公里，密度为3.38公里/平方公里。

    铁路:京沪铁路（北为津浦线、东为沪宁线）、宁芜铁路和宁启铁路(现只到南通)交汇于南京，使南京成为连接北部、东部和中部的重要交通枢纽。规划建设的有宁西铁路、宁杭铁路、宁淮铁路以及沿江铁路。
航空

    航空:禄口国际机场距南京市中心直线距离为35.8公里，目前可满足年旅客吞吐量1200万人次、年货邮吞吐量40万吨；总体规划为年飞行36万架次，年旅客吞吐量4000万人次，货邮吞吐量100万吨。2004年实际旅客接待量457.4万人次，货邮吞吐量13.8万吨。目前机场有85条国内国际航线，国际客运航线目的地有日本、韩国、泰国和新加坡等地，货远航线目的地有韩国、新加坡、泰国、美国、荷兰等地。

    水运:南京港是中国最大的内河港口，2004年吞吐量1.18亿吨，外贸集装箱吞吐量为近50万标箱。港区全长98公里，有64个泊位，其中16个可停靠万吨级船舶。南京港同时是长江沿岸最大的集装箱港。